Berawal dari terjadinya Letusan Gunung Merapi Tahun 1961 menjadi faktor utama yang mendorong dilaksanakannya program transmigrasi bedol desa. Transmigrasi dengan konsep bedol desa merupakan pemindahan penduduk yang meliputi seluruh penduduk desa beserta pejabat-pejabat pemerintah desa ke daerah transmigrasi. Dari peristiwa tersebut, program transmigrasi memindahkan penduduk dari beberapa desa di Kabupaten Magelang, Jawa Tengah ke wilayah Balau Kedaton, Lampung. Perpindahan penduduk tersebut menyebabkan wilayah Balau Kedaton yang semula jarang memiliki penduduk kemudian menjadi wilayah yang cukup padat penduduk.

Transmigrasi Bedol Desa Ini dilakukan beberapa Tahap, Pada awal mula Nama Lokasi Trasmigrasi ini Blok A, Blok B, Blok C, Blok D, Blok E dan Blok F. Blok A dan Blok B ini sekarang secara Adminitrasi menjadi Desa Marga Kaya, kemudian Blok C, Blok D dan Blok E Secara Adminitrasi Menjadi Desa Marga Agung. Lalu Blok F saat ini Secara Adminitrasi Menjadi Desa Margodadi. Nama Blok F sendiri tidak begitu familiar dikalangan Masyarakat Desa Margodadi saat ini. Tidak seperti Blok A sampai dengan Blok E yang masih sering disebut dan dikena oleh masyarakat.

Kepala Desa Margodadi yang pertama kali adalah Bapak Jaudi, Kemudian Bapak Sastro sebagai Pjs, Kepala Desa Ke Tiga Adalah Bapak Peno, Kepala Desa Ke Empat Adalah Bapak Juahir, Kepala Desa Ke Lima adalah Bapak Wiryo Supriyogi, Kepala Desa Ke Enam Adalah Bapak Sutrimo, Kepala Desa Ke Tujuh adalah Bapak Sutrimo, Kepala Desa Ke Delapan Adalah Nuryusman dan Kepala Desa ke Sembilan Bapak Sutrimo dan kepala Desa Ke Sepuluh adalah Bapak Noven Fahri.

Desa Margodadi awalnya terdiri dari 4 Dusun, Adapaun Nama Nama Dusun Pada Awal kedatangannya adalah Dusun Roto Jajar, Dusun Margodadi, Dusun Sumber Rejo dan Dusun Sudi Moro kemudian dusun itu berubah menjadi Dusun 1 (Satu) sampai dengan 4 (Empat).

Lalu Sekitar Tahun 2002 terjadi pemekaran Dusun, Dusun Satu dimekaran menjadi dua dusun, yaitu Dusun 1 (Satu) dan Dusun 5 (Lima).

Dusun Roto Jajar pada era saat ini lebih dikenal dengan nama Dusun 5, Dusun Margodadi saat ini dikenal dengan Dusun 1, Dusun Sumber Rejo menjadi Dusun 2 dan Dusun Sudi Moro Menjadi Dusun 3 dan Dusun 4

Pada awal Transmigrasi secara administrasi Desa Margodadi termasuk dalam wilayah kecamatan Natar. Beberapa tahun kemudian dipindahkan ke kecamatan Balau Kedaton kabupaten Lampung Selatan. Dan beberapa tahun kemudian pengembangan kecamatan masuk ke kecamatan Tanjung Bintang, tidak lama kemudian ikut pemekaran kecamatan menjadi Kecamatan Jati Agung sampai sekarang.

Namun walaupun desa margodadi ini merupakan desa transmigrasi tetapi penduduknya saat ini sudah terdiri dari bermacam macam suku. Diantaranya Jawa, Lampung, Padang, Sunda, Palembang. Hal ini membuat Desa Margodadi semakin cepat berkembang baik dalam dunia perekonomian maupun seni budaya.